一般纳税人取得 3% 农产品专用发票，可根据 9%/10% 计算扣除！
当然，各地税务机关执行口径有几率存在差别，具体建议还是咨询一下当地税务机关。
A 公司为增值税一般纳税人，取得小规模纳税人 B 公司开具的一张农产品专用发票，发票金额 100000 元，税额 3000 元。
A 公司在购入时，按 9% 计算抵扣进项税，领用进行深加工时（加工 13% 税率的货物），再加计1%进项税额。（即可根据10%扣除）
既然提到抵扣，我们也顺带着说一下税控发票的抵扣事宜，日常也有不少朋友会问到，今天我们也统一回复一下~
一般纳税人初次购买税控系统，可凭取得的专票，全额（价税合计额）抵减增值税。
这项优惠政策仅限初次购买税控系统的。如果再次购买的，发票直接认证抵扣，不允许全额抵减增值税。
同样是（财税〔2012〕15号），企业每年向航天信息或百旺金赋缴纳技术维护费，取得增值税普通发票的，可以全额抵减增值税。
温馨提示：此处是每年取得技术维护费都可以全额抵减增值税，不足抵减的可以结转下期抵减。
关于抵扣，还有一个问题也一直困扰着不少人，那就是购进按13%抵扣，但是给客户开的票是9%或者6%，是不是可行。
我们是一家机电安装公司，购进机电设施用于安装，抵扣的13%，当然一般计税的情况下允许开具9%的安装费发票。
我们是一家酒店住宿公司，购进酒店用品用于客人房间中，抵扣的13%，当然一般计税的情况下允许开具6%的住宿费发票。
根据财税〔2016〕36号附件1第四十条的规定：“一项销售行为如果既涉及服务又涉及货物，为混合销售行为。从事货物的生产、批发或者零售的单位和个体工商户的混合销售行为，按照销售货物缴纳增值税;其他单位和个体工商户的混合销售行为，按照销售服务缴纳增值税。”
我们是一家建筑公司，购进建筑材料用于施工，抵扣的13%，当然一般计税的情况下允许开具9%的工程款发票。
我们是一家运输公司，购进货车用于运输，抵扣的13%，当然一般计税的情况下允许开具9%的运费发票。
注意：以上两种行为必须是在一般计税方法下，才可以抵扣进项税，若是采用的简易计税方法，是不允许抵扣进项税的。
“第二十七条 下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：（一）用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、加工修理修配劳务、服务、非货币性资产和不动产。其中涉及的固定资产、非货币性资产、不动产，仅指专用于上述项目的固定资产、非货币性资产（不包含别的权益性非货币性资产）、不动产。纳税人的交际应酬消费属于个人消费。”
所以，在日常经营中，增值税并不是进项13%抵扣，销项就要按照13%来开票，大家平时也可以注意一下这些细小的知识点，对提高个人的专业能力也是有帮助的哦~
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