由于信息技术相关业务专业性较强，且技术开发服务、软件服务的判定有可能会出现模糊和混淆的情况，所以，部分软件开发企业承接软件开发业务后，按照自己的理解去签署合同和开具发票，容易将软件服务混同于技术开发服务，从而享受增值税免税优惠。这样一来，企业会涉嫌产生少缴增值税的风险。
A公司属于增值税一般纳税人，是一家专门从事信息技术服务、软件开发服务的公司。2021年4月，A公司与B公司签订合同，为B公司提供管理系统升级改造、监测系统开发服务，合同标的1000万元。合同签订后，A公司到省科技厅办理了该合同的技术合同认定登记，并报主管税务机关备查。
A公司认为，根据《科学技术部关于印发〈技术合同认定规则〉的通知》(国科发政字〔2001〕253号)，其附件《技术合同认定规则》第二十三条明确，技术改造项目和信息技术的研究开发项目，对应的合同属于技术开发合同。其中，信息技术探讨研究开发项目包括语言系统、过程控制、管理工程、特定专家系统、计算机辅助设计、计算机集成制造系统等，但不包括软件复制和无原创性的程序编制。其向B公司提供的管理系统升级改造、监测系统开发服务，属技术开发的范畴。
依据《财政部、国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税〔2016〕36号)附件3《营业税改征增值税试点过渡政策的规定》第一条的规定，纳税人提供技术转让、技术开发和与之相关的技术咨询、技术服务，免征增值税。试点纳税人申请免征增值税时，须持技术转让、开发的书面合同，到纳税人所在地省级科技主管部门进行认定，并持有关的书面合同和科技主管部门审核意见证明文件，报主管税务机关备查。由于上述合同已在省科技厅进行了技术合同认定登记，其收入应免征增值税。
要判断A公司的这笔收入是否免征增值税，不能仅看服务合同是不是已经在科技部门备案登记，第一步是要判断A公司为B公司提供的服务是技术开发服务，还是软件服务。只有技术开发服务，才符合免征增值税政策的规定，否则，应计算缴纳增值税。
从业务实质上分析，A公司提供的服务，应属于软件服务的范畴。财税〔2016〕36号文件附件1《销售服务、非货币性资产、不动产注释》明确规定，研发服务，也称技术开发服务，是指就新技术、新产品、新工艺或者新材料及其系统来进行研究与试验开发的业务活动。而软件服务是指提供软件开发服务、软件维护服务、软件测试服务的业务活动。从业务实质上看，A公司向B公司提供的管理系统升级改造和监测系统开发服务，不是新技术及其系统的研究开发，而是软件的升级改造和开发服务，不属于研发服务，而应该是软件服务。
在该案例中，纳税人取得的相应收入免税与否，应以税收政策规定为依据。虽然A公司的此份合同已经在省级科技部门认定为技术合同，但按《销售服务、非货币性资产、不动产注释》规定，A公司提供的服务属于软件服务，不能免税。同时，虽然A公司的相关减免税资料已报主管税务机关备查，但是不是满足免税条件由纳税人自行判别、风险自担，税务机关一般会用诚信推定原则，只进行资料的完整性审查，事后发现不符合减免税条件的，税务机关仍有权追征税款。
软件开发企业对承接的业务，应结合具体业务性质，判定其是不是满足技术开发服务。即使符合科技部门《技术合同认定规则》，被科技部门认定为技术开发合同，在税务处理时，还是该结合税收政策的规定，判断是不是满足免征增值税条件，防范少缴增值税的风险。
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